「申告書の法人名」とは「別の法人名」をライセンスファイルに登録してしまいました。登録法人名を変更してもらえますか？

基本的に「ライセンス登録名の変更」には対応できません。
「別の法人名」のためのライセンスファイルが必要な場合は、「別の法人名」のためのライセンスファイルをご購入ください。
※「商号変更(社名・法人名変更)」の場合も「変更後の法人名」のためのライセンスファイルをご購入ください。